Embase

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RLP

Como citar

Pacheco RL, Martimbianco ALC, Riera, R. Princípios de busca em base de dados. 2022. Disponível em: www.nepsbeats.com.

Embase (via Elsevier)

O Embase é uma base de dados mantida desde 1947 com mais de 8,500 periódicos identificados. Ela possui um grande acervo de periódicos que não estão indexados no Medline. Por isso, o Embase é considerado uma base principal e obrigatória em uma revisão sistemática.

Diferentemente do PubMed, o Embase é uma base paga. No Brasil, podemos acessá-la pelo portal de periódicos Capes.

O portal de periódicos Capes possui uma plataforma de acesso remoto (Acesso CAFe), neste link: https://www-periodicos-capes-gov-br.ez69.periodicos.capes.gov.br/index.php/acesso-cafe.html. Checar se sua instituição possui acesso e verificar a forma de login. Usualmente o login e senha é o mesmo da sua conta INTRANET, mas isso pode variar de instituição para instituição. Qualquer dúvida de acesso deve ser resolvida com a biblioteca da sua instituição, uma vez que os processos de autorização podem variar.

Após login via CAFe, você deve ir em -> “acervo” -> “lista de bases” e buscar o site do Embase.

O Embase utiliza um sistema de descritores denominado Emtree. Para traduzir a estratégia de busca do PubMed para o Embase, devemos identificar os Emtree’s correspondentes aos MeSH’s utilizados.

Estruturando uma estratégia de busca no Embase

Traduziremos para o Embase a estratégia de busca para identificar estudos que avaliaram a efetividade do modafinil em pacientes com acidente vascular cerebral.

Figura 1. Busca estruturada no PubMed

Na página inicial do Embase, iremos acessar a página de busca por Emtree’s (seta vermelha, figura 2).

Figura 2. Página inicial do Embase

Buscaremos o termo “Stroke”, como demonstrado na figura 3. Este é o mesmo termo MeSH utilizado na estruturação da linha da população na busca do PubMed (figura 1).

Figura 3. Identificando o termo Emtree no Embase

Podemos notar na figura 4 que o termo Emtree equivalente ao “stroke” é “cerebrovascular accident”. Clicamos no termo para adicioná-lo na nossa estratégia de busca.

Figura 4. Termo Emtree identificado

Após acessar as informações do termo e checar sua adequação a nossa pergunta esturutrada, iremos adicionar ele ao “query builder” (seta vermelha, figura 5) para iniciar a construção da estratégia.

O Embase também oferece uma lista de sinônimos que podemos complementar como termos livres para aumentar a sensibilidade da nossa estratégia de busca (seta azul, figura 5). Podemos clicar em “copy” (seta amarela, figura 5) para recuperar facilmente os termos livres já conectados pelo operador booleano OR.

Figura 5. Página de termo Emtree no Embase

Após clicar em “add to query builder”, devemos clicar em “Take to Advanced Search” (figura 6).

Figura 6. Acessando a busca avançada no Embase

Na busca avançada, iremos conectar com OR os termos livres/sinônimos referentes a nossa população. Podemos utilizar os mesmos termos utilizados no PubMed, mas sempre é interessante checar as listas de sinônimos do Embase também.

IMPORTANTE! O Embase utiliza aspas simples e não aspas duplas. Ou seja, qualquer termo delimitado por aspas duplas na estratégia do PubMed deve ser transformado em aspas simples no Embase.

Vale notar que ao se utilizar parênteses no Embase, a base irá conectar cada termo dentro dos parênteses pelo operador booleano AND, o que irá aumentar consideravelmente a sensibilidade da busca. Por exemplo, o termo (acute focal cerebral vasculopathy) será transformado pela base em:

(acute AND focal AND cerebral AND vasculopathy)

Esta transformação aumentará substancialmente a quantidade de referências recuperadas. Caso a busca esteja extremamente sensível, delimitar todos os termos livres por aspas simples pode ser uma opção viável.

A figura 7 demonstra o termo Emtree em sua forma no Embase (‘cerebrovascular accident’/exp) e os mesmos sinônimos utilizados na estratégia do PubMed (figura 1), já convertidos para aspas simples. Após a linha estiver completa, clicamos em “Search”.

Figura 7. Linha da população estruturada na interface de busca avançada no Embase.

A figura 8. apresenta a interface de resultados já com a linha de população adicionada pela base.

Figura 8 Referências obtidas pela linha referente à população

Depois, clicamos em Emtree de novo para buscar o termo equivalente ao MeSH modafinil e repetimos o processo para finalizar a construção da estratégia de busca.

A figura 9. apresenta as duas linhas já conectadas pelo operador booleano AND. Podemos notar que foram identificadas 254 referências.

Figura 9 Resultados da busca estruturada no Embase

Um passo importante é retirar as referências de periódicos que já estão indexados no Medline. Podemos acessar o filtro lateral “Sources” e selecionar apenas referências do Embase e aplicar o filtro como demonstrado na seta vermelha da figura 10.

Figura 10. Retirando referências encontradas no Medline

A figura 11 apresenta o resultado final. O uso do filtro lateral adicionou a seguinte linha para remover estudos no Medline:

[embase]/lim NOT ([embase]/lim AND [medline]/lim

Nota-se que 97 referências foram identificadas apenas no Embase.

Figura 11. Resultado final da busca após exclusão de referências de periódicos indexados no Medline.

Aplicação de filtros

A figura 12 apresenta a aplicação de filtro de data. No caso, buscamos por referências incluídas no Embase entre 01 de janeiro de 2020 e 01 de janeiro de 2023.

Figura 12. Aplicação de filtro de data

Basicamente, a base de dados aplicou uma nova linha à nossa estratégia:

[01-01-2020]/sd NOT [02-01-2023]/sd

A figura 13 apresenta o resultado da estratégia com as 26 referências recuperadas após aplicação de limite de data.

Figura 13. Referências recuperadas após aplicação de filtro de data

Existem vários filtros validados para desenho de estudo no Embase. Nesta página, mantemos atualizado diversos filtros validados para identificar diferentes tipos de desenho de estudo em diversas bases de dados. Basicamente, iremos copiar o filtro e adicioná-lo como uma linha na estratégia.

Iremos adicionar o seguinte filtro para recuperar ensaios clínicos randomizados:

('randomized controlled trial'/de OR 'controlled clinical trial'/de OR random*:ti,ab,tt OR 'randomization'/de OR 'intermethod comparison'/de OR placebo:ti,ab,tt OR compare:ti,tt OR compared:ti,tt OR comparison:ti,tt OR ((evaluated:ab OR evaluate:ab OR evaluating:ab OR assessed:ab OR assess:ab) AND (compare:ab OR compared:ab OR comparing:ab OR comparison:ab)) OR ((open NEXT/1 label):ti,ab,tt) OR (((double OR single OR doubly OR singly) NEXT/1 (blind OR blinded OR blindly)):ti,ab,tt) OR 'double blind procedure'/de OR ((parallel NEXT/1 group*):ti,ab,tt) OR crossover:ti,ab,tt OR 'cross over':ti,ab,tt OR (((assign* OR match OR matched OR allocation) NEAR/6 (alternate OR group OR groups OR intervention OR interventions OR patient OR patients OR subject OR subjects OR participant OR participants)):ti,ab,tt) OR assigned:ti,ab,tt OR allocated:ti,ab,tt OR ((controlled NEAR/8 (study OR design OR trial)):ti,ab,tt) OR volunteer:ti,ab,tt OR volunteers:ti,ab,tt OR 'human experiment'/de OR trial:ti,tt) NOT (((random* NEXT/1 sampl* NEAR/8 ('cross section*' OR questionnaire* OR survey OR surveys OR database OR databases)):ti,ab,tt) NOT ('comparative study'/de OR 'controlled study'/de OR 'randomised controlled':ti,ab,tt OR 'randomized controlled':ti,ab,tt OR 'randomly assigned':ti,ab,tt) OR ('cross‐sectional study' NOT ('randomized controlled trial'/de OR 'controlled clinical study'/de OR 'controlled study'/de OR 'randomised controlled':ti,ab,tt OR 'randomized controlled':ti,ab,tt OR 'control group':ti,ab,tt OR 'control groups':ti,ab,tt)) OR ('case control*':ti,ab,tt AND random*:ti,ab,tt NOT ('randomised controlled':ti,ab,tt OR 'randomized controlled':ti,ab,tt)) OR ('systematic review':ti,tt NOT (trial:ti,tt OR study:ti,tt)) OR (nonrandom*:ti,ab,tt NOT random*:ti,ab,tt) OR 'random field*':ti,ab,tt OR (('random cluster' NEAR/4 sampl*):ti,ab,tt) OR (review:ab AND review:it NOT trial:ti,tt) OR ('we searched':ab AND (review:ti,tt OR review:it)) OR 'update review':ab OR ((databases NEAR/5 searched):ab) OR ((rat:ti,tt OR rats:ti,tt OR mouse:ti,tt OR mice:ti,tt OR swine:ti,tt OR porcine:ti,tt OR murine:ti,tt OR sheep:ti,tt OR lambs:ti,tt OR pigs:ti,tt OR piglets:ti,tt OR rabbit:ti,tt OR rabbits:ti,tt OR cat:ti,tt OR cats:ti,tt OR dog:ti,tt OR dogs:ti,tt OR cattle:ti,tt OR bovine:ti,tt OR monkey:ti,tt OR monkeys:ti,tt OR trout:ti,tt OR marmoset*:ti,tt) AND 'animal experiment'/de) OR ('animal experiment'/de NOT ('human experiment'/de OR 'human'/de)))

A figura 14 apresenta o resultado da busca após aplicação de filtro para ensaios clínicos randomizados. Percebemos que o número de referências caiu de 26 para 5.

Figura 14. Referências recuperadas após aplicação de filtro de data e desenho de estudo.

--- title: "Embase" author: RLP format: html: code-fold: true code-tools: true css: style.css editor_options: chunk_output_type: inline execute: warning: false --- **Como citar** Pacheco RL, Martimbianco ALC, Riera, R. Princípios de busca em base de dados. 2022. Disponível em: www.nepsbeats.com. ------------------------------------------------------------------------ ### Embase (via Elsevier) O Embase é uma base de dados mantida desde 1947 com mais de 8,500 periódicos identificados. Ela possui um grande acervo de periódicos que não estão indexados no Medline. Por isso, o Embase é considerado uma base principal e obrigatória em uma revisão sistemática. Diferentemente do PubMed, o Embase é uma base paga. No Brasil, podemos acessá-la pelo portal de periódicos Capes. O portal de periódicos Capes possui uma plataforma de acesso remoto (Acesso CAFe), neste link: <https://www-periodicos-capes-gov-br.ez69.periodicos.capes.gov.br/index.php/acesso-cafe.html.> Checar se sua instituição possui acesso e verificar a forma de login. Usualmente o login e senha é o mesmo da sua conta INTRANET, mas isso pode variar de instituição para instituição. Qualquer dúvida de acesso deve ser resolvida com a biblioteca da sua instituição, uma vez que os processos de autorização podem variar. Após login via CAFe, você deve ir em -\> “acervo” -\> “lista de bases” e buscar o site do Embase. O Embase utiliza um sistema de descritores denominado Emtree. Para traduzir a estratégia de busca do PubMed para o Embase, devemos identificar os Emtree’s correspondentes aos MeSH’s utilizados. ### Estruturando uma estratégia de busca no Embase Traduziremos para o Embase a estratégia de busca para identificar estudos que avaliaram a efetividade do modafinil em pacientes com acidente vascular cerebral. **Figura 1**. Busca estruturada no PubMed ![figura 1](https://user-images.githubusercontent.com/98093302/210579148-73fa3c07-9e3a-4cf9-acdc-241a5cf0e39b.png) Na página inicial do Embase, iremos acessar a página de busca por Emtree’s (seta vermelha, **figura 2**). **Figura 2**. Página inicial do Embase ![figura 2](https://user-images.githubusercontent.com/98093302/210579196-fb0f857e-8bfe-4f29-8f10-adb4d219a864.png) Buscaremos o termo “Stroke”, como demonstrado na **figura 3**. Este é o mesmo termo MeSH utilizado na estruturação da linha da população na busca do PubMed (**figura 1**). **Figura 3**. Identificando o termo Emtree no Embase ![figura 3](https://user-images.githubusercontent.com/98093302/210579257-45487190-a3c5-4216-81a7-c62c38083e40.png) Podemos notar na **figura 4** que o termo Emtree equivalente ao “stroke” é “cerebrovascular accident”. Clicamos no termo para adicioná-lo na nossa estratégia de busca. **Figura 4**. Termo Emtree identificado ![figura 4](https://user-images.githubusercontent.com/98093302/210579342-c664d105-89c8-4c9f-b492-c4e71c329e8a.png) Após acessar as informações do termo e checar sua adequação a nossa pergunta esturutrada, iremos adicionar ele ao “query builder” (seta vermelha, **figura 5**) para iniciar a construção da estratégia. O Embase também oferece uma lista de sinônimos que podemos complementar como termos livres para aumentar a sensibilidade da nossa estratégia de busca (seta azul, **figura 5**). Podemos clicar em “copy” (seta amarela, **figura 5**) para recuperar facilmente os termos livres já conectados pelo operador booleano OR. **Figura 5**. Página de termo Emtree no Embase ![figura 5](https://user-images.githubusercontent.com/98093302/210579412-64e1785a-f2fe-41b7-9782-73e95c562845.png) Após clicar em “add to query builder”, devemos clicar em “Take to Advanced Search” (**figura 6**). **Figura 6**. Acessando a busca avançada no Embase ![figura 6](https://user-images.githubusercontent.com/98093302/210579484-8c3d7d15-196f-4495-9d22-35216dfe0745.png) Na busca avançada, iremos conectar com OR os termos livres/sinônimos referentes a nossa população. Podemos utilizar os mesmos termos utilizados no PubMed, mas sempre é interessante checar as listas de sinônimos do Embase também. **IMPORTANTE!** O Embase utiliza **aspas simples** e não aspas duplas. Ou seja, qualquer termo delimitado por aspas duplas na estratégia do PubMed deve ser transformado em aspas simples no Embase. Vale notar que ao se utilizar parênteses no Embase, a base irá conectar cada termo dentro dos parênteses pelo operador booleano AND, o que irá aumentar consideravelmente a sensibilidade da busca. Por exemplo, o termo *(acute focal cerebral vasculopathy)* será transformado pela base em: ``` (acute AND focal AND cerebral AND vasculopathy) ``` Esta transformação aumentará substancialmente a quantidade de referências recuperadas. Caso a busca esteja extremamente sensível, delimitar todos os termos livres por aspas simples pode ser uma opção viável. A **figura 7** demonstra o termo Emtree em sua forma no Embase (*'cerebrovascular accident'/exp*) e os mesmos sinônimos utilizados na estratégia do PubMed (**figura 1**), já convertidos para aspas simples. Após a linha estiver completa, clicamos em “Search”. **Figura 7**. Linha da população estruturada na interface de busca avançada no Embase. ![figura 7](https://user-images.githubusercontent.com/98093302/210579585-3c37e14b-d6dd-447c-b5d8-a10dbf245e4b.png) A **figura 8**. apresenta a interface de resultados já com a linha de população adicionada pela base. **Figura 8** Referências obtidas pela linha referente à população ![figura 8](https://user-images.githubusercontent.com/98093302/210579648-743a2732-7407-467d-a401-d7be538f3b5c.png) Depois, clicamos em Emtree de novo para buscar o termo equivalente ao MeSH modafinil e repetimos o processo para finalizar a construção da estratégia de busca. A **figura 9**. apresenta as duas linhas já conectadas pelo operador booleano AND. Podemos notar que foram identificadas 254 referências. **Figura 9** Resultados da busca estruturada no Embase ![figura 9](https://user-images.githubusercontent.com/98093302/210579726-213d6701-1f6d-469d-ae80-0b34465b9db0.png) Um passo importante é retirar as referências de periódicos que já estão indexados no Medline. Podemos acessar o filtro lateral “Sources” e selecionar apenas referências do Embase e aplicar o filtro como demonstrado na seta vermelha da **figura 10**. **Figura 10**. Retirando referências encontradas no Medline ![figura 10](https://user-images.githubusercontent.com/98093302/210579777-7b3df41b-420e-421e-bc45-9bf2d8ceed4d.png) A **figura 11** apresenta o resultado final. O uso do filtro lateral adicionou a seguinte linha para remover estudos no Medline: ``` [embase]/lim NOT ([embase]/lim AND [medline]/lim ``` Nota-se que 97 referências foram identificadas apenas no Embase. **Figura 11**. Resultado final da busca após exclusão de referências de periódicos indexados no Medline. ![figura 11](https://user-images.githubusercontent.com/98093302/210579872-b515afd1-c21a-4d72-ab51-120d55fec6fe.png) ### Aplicação de filtros A **figura 12** apresenta a aplicação de filtro de data. No caso, buscamos por referências incluídas no Embase entre 01 de janeiro de 2020 e 01 de janeiro de 2023. **Figura 12**. Aplicação de filtro de data ![figura 12](https://user-images.githubusercontent.com/98093302/210579936-c1b81859-790b-4d28-8fbb-39409b0e23fb.png) Basicamente, a base de dados aplicou uma nova linha à nossa estratégia: ``` [01-01-2020]/sd NOT [02-01-2023]/sd ``` A **figura 13** apresenta o resultado da estratégia com as 26 referências recuperadas após aplicação de limite de data. **Figura 13**. Referências recuperadas após aplicação de filtro de data ![figura 13](https://user-images.githubusercontent.com/98093302/210580122-f7b12d0b-e801-4ae8-a739-9af64262a1b3.png) Existem vários filtros validados para desenho de estudo no Embase. Nesta [página](https://github.com/rlpacheco/search_filters_database), mantemos atualizado diversos filtros validados para identificar diferentes tipos de desenho de estudo em diversas bases de dados. Basicamente, iremos copiar o filtro e adicioná-lo como uma linha na estratégia. Iremos adicionar o seguinte filtro para recuperar ensaios clínicos randomizados: ``` ('randomized controlled trial'/de OR 'controlled clinical trial'/de OR random*:ti,ab,tt OR 'randomization'/de OR 'intermethod comparison'/de OR placebo:ti,ab,tt OR compare:ti,tt OR compared:ti,tt OR comparison:ti,tt OR ((evaluated:ab OR evaluate:ab OR evaluating:ab OR assessed:ab OR assess:ab) AND (compare:ab OR compared:ab OR comparing:ab OR comparison:ab)) OR ((open NEXT/1 label):ti,ab,tt) OR (((double OR single OR doubly OR singly) NEXT/1 (blind OR blinded OR blindly)):ti,ab,tt) OR 'double blind procedure'/de OR ((parallel NEXT/1 group*):ti,ab,tt) OR crossover:ti,ab,tt OR 'cross over':ti,ab,tt OR (((assign* OR match OR matched OR allocation) NEAR/6 (alternate OR group OR groups OR intervention OR interventions OR patient OR patients OR subject OR subjects OR participant OR participants)):ti,ab,tt) OR assigned:ti,ab,tt OR allocated:ti,ab,tt OR ((controlled NEAR/8 (study OR design OR trial)):ti,ab,tt) OR volunteer:ti,ab,tt OR volunteers:ti,ab,tt OR 'human experiment'/de OR trial:ti,tt) NOT (((random* NEXT/1 sampl* NEAR/8 ('cross section*' OR questionnaire* OR survey OR surveys OR database OR databases)):ti,ab,tt) NOT ('comparative study'/de OR 'controlled study'/de OR 'randomised controlled':ti,ab,tt OR 'randomized controlled':ti,ab,tt OR 'randomly assigned':ti,ab,tt) OR ('cross‐sectional study' NOT ('randomized controlled trial'/de OR 'controlled clinical study'/de OR 'controlled study'/de OR 'randomised controlled':ti,ab,tt OR 'randomized controlled':ti,ab,tt OR 'control group':ti,ab,tt OR 'control groups':ti,ab,tt)) OR ('case control*':ti,ab,tt AND random*:ti,ab,tt NOT ('randomised controlled':ti,ab,tt OR 'randomized controlled':ti,ab,tt)) OR ('systematic review':ti,tt NOT (trial:ti,tt OR study:ti,tt)) OR (nonrandom*:ti,ab,tt NOT random*:ti,ab,tt) OR 'random field*':ti,ab,tt OR (('random cluster' NEAR/4 sampl*):ti,ab,tt) OR (review:ab AND review:it NOT trial:ti,tt) OR ('we searched':ab AND (review:ti,tt OR review:it)) OR 'update review':ab OR ((databases NEAR/5 searched):ab) OR ((rat:ti,tt OR rats:ti,tt OR mouse:ti,tt OR mice:ti,tt OR swine:ti,tt OR porcine:ti,tt OR murine:ti,tt OR sheep:ti,tt OR lambs:ti,tt OR pigs:ti,tt OR piglets:ti,tt OR rabbit:ti,tt OR rabbits:ti,tt OR cat:ti,tt OR cats:ti,tt OR dog:ti,tt OR dogs:ti,tt OR cattle:ti,tt OR bovine:ti,tt OR monkey:ti,tt OR monkeys:ti,tt OR trout:ti,tt OR marmoset*:ti,tt) AND 'animal experiment'/de) OR ('animal experiment'/de NOT ('human experiment'/de OR 'human'/de))) ``` A **figura 14** apresenta o resultado da busca após aplicação de filtro para ensaios clínicos randomizados. Percebemos que o número de referências caiu de 26 para 5. **Figura 14**. Referências recuperadas após aplicação de filtro de data e desenho de estudo. ![figura 14](https://user-images.githubusercontent.com/98093302/210580231-34e780af-2519-4b67-8cda-42eae32b301a.png)